Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms