Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms