Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms