Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms