Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms