Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sec23aQ01405 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms