Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms