Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EgfrQ01279 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms