Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms