Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms