Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms