Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GabpaQ00422 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabpaQ00422 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms