Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms