Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds1P98191 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds1P98191 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds1P98191 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cds1P98191 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms