Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VldlrP98156 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms