Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shc1P98083 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms