Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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