Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlkP97793 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlkP97793 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AlkP97793 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AlkP97793 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AlkP97793 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlkP97793 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlkP97793 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlkP97793 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AlkP97793 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms