Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
rp9P97762 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
rp9P97762 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
rp9P97762 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
rp9P97762 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
rp9P97762 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms