Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-2P97503 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms