Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms