Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms