Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bop1P97452 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms