Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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