Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim43bP86448 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim43bP86448 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms