Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Arf1P84078 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf1P84078 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Arf1P84078 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Arf1P84078 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf1P84078 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf1P84078 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Arf1P84078 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arf1P84078 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arf1P84078 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf1P84078 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms