Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgcgP82348 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgcgP82348 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms