Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcdP82347 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgcdP82347 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgcdP82347 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms