Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cct7P80313 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cct7P80313 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms