Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms