Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx1P70323 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx1P70323 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms