Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb13P70321 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms