Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux2P70298 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux2P70298 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux2P70298 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms