Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf6P70279 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms