Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms