Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms