Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms