Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms