Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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