Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms