Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbpl1P62340 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms