Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms