Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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