Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lmo4P61969 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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