Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms