Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms