Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl27P61358 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl27P61358 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms