Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme3P61290 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms