Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abce1P61222 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms