Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf13P61216 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms